Le premier temple chrétien sur l’emplacement de l’actuelle église paroissiale Saint-Nicolas-Sainte-Madeleine pourrait avoir été construit entre le XIe et le XIIe siècle.
Des recherches menées en 1957 ont permis de découvrir sur l’un des murs de l’église une polychromie datée de la seconde moitié du XIIe siècle. Des polychromies similaires n’ont été identifiées que dans trois autres sites en Pologne. Comme l’église de Dziekanowice est très petite, pendant de longues années la paroisse tentait d’obtenir la permission de bâtir un temple plus spacieux. Enfin le curé, ancien prisonnier à l’époque du stalinisme, a reçu des autorités le feu vert pour faire construire un nouvel édifice religieux. Aussi à côté de l’ancien temple a-t-on érigé l’église de la Maternité-de-Marie où on a ensuite transféré la majorité de mobilier historique. En 1966, l’année du millénaire de l’adoption du christianisme par la Pologne (le prince Mieszko Ier s’était fait baptiser en 966), l’archevêque Karol Wojtyła a consacré le nouveau temple en tant qu’une manifestation de reconnaissance pour le millénaire de la foi chrétienne sur les terres polonaises. L’ancienne église n’étant plus utilisée, depuis cette époque sa dégradation progresse.