L’église en pierre fut érigée dans la seconde moitié du XVIIIème siècle grâce aux fonds du prince August Adam Czartoryski, qui était à l’époque le propriétaire de Wilanów. Lors de la Première et de la Seconde Guerre mondiale, l’église et son entourage furent pillés et dévastés. En 1944, les Allemands transformèrent l’église en un endroit pour internés, notamment ceux de l’intelligentsia de la capitale et ceux de ses environs.
Les travaux de conservation rigoureux ne commencèrent que dans les années 80 du XXème siècle. L’intérieur cache de très belles décorations de valeur historique tout comme les sarcophages et les épitaphes des propriétaires de Wilanów, dont les tombeaux se trouvent dans la crypte, au-dessous de la chapelle. Dans le Campanile du Troisième Millénaire récemment construit se trouvent trois cloches de 1723 et 1777. Elles survécurent aux deux guerres mondiales parce que la population de Wilanów les avait cachées dans les petits dômes de l’église. Cette dernière est entourée par les stations de la Passion du Christ, construites au XIXème siècle.