Construite dans les années 1552-57 à l’initiative de la famille Kościelecki grâce à une autorisation émise par le roi Sigismond Auguste. Détruite et reconstruit à plusieurs reprises. Depuis 1860 elle faisait office d’église militaire de la garnison prussienne de la ville et après le recouvrement de l’indépendance par la Pologne elle servait d’église militaire à la garnison polonaise. Le temple se distingue par des polychromies du XVIIe (les plus anciennes polychromies qui se sont conservées à Bydgoszcz), chaire rococo et voûtes intéressantes en termes d’architecture et d’ornementation. L’église jouxte un ancien couvent des Bernardins dont le siège appartient actuellement à l’Université de technologie et d’industrie.