La superficie totale des surfaces d’exposition de l’établissement est d’environ 900 mètres carrés. Les collections sont reparties sur trois étages et le rez-de-chaussée.

Les éléments les plus intéressants du musée est le modèle du fond de la mer Baltique et la salle aquatique. Le musée dispose aussi d’une salle de cinéma et de salles de classes (salle d’éducation pour enfants, salle d’expérimentations aquatiques, salle d’écologie maritime multimédias) équipées de matériel audiovisuel moderne et de supports didactiques pour enfants.

Le bâtiment est adapté aux besoins des personnes handicapées.